Действие происходит в вымышленном параллельном мире, где переплетены наука и магия, помимо людей обитают ведьмы, бронированные медведи и другие фантастические персонажи. Управляет миром религиозная организация — Магистериум.

Главная героиня — девочка Лира Белаква — живёт в Оксфорде при одном из колледжей. Родители Лиры погибли, а её дядя — могущественный лорд Азриэл — совершает частые экспедиции на Север. Во время одной из экспедиций он находит мистическую Пыль и собирается открыть лабораторию для её изучения.

Лира отправляется в опасное путешествие на Север, чтобы спасти своего похищенного друга Роджера и узнать правду о Пыли. В этом ей помогают броняной медведь Иорек Бирнисон, ведьма Серафина Пеккала и аэронавт Ли Скорсби.